在Windows XP/2000中，只有提供將FAT32轉換成NTFS檔案系統的工具，而沒有將NTFS轉換成FAT32檔案系統的工具。如果要把NTFS轉換成FAT32，可以透過Partition Magic這個軟體，不論是NTFS轉FAT32，或FAT32轉NTFS，都可以用這個軟體做到喔！

在Windows XP和2000中，提供了convert程式將FAT檔案系統轉換成NTFS檔案系統，這個程式必須在命令提示字元下輸入指令執行，操作步驟如下：

1. 在【開始】上按一下滑鼠左鍵，從選單中點選【所有程式】→【附屬應用程式】→【命令提示字元】。在命令列上輸入「CONVERT 磁碟機代號 /fs:ntfs」，例如我們要轉換F磁碟機，則輸入「CONVERT F: /fs:ntfs」，再按下Enter鍵。

2. 轉換之前，會要求你輸入該磁碟的標籤名稱，如果你不清楚磁碟的標籤名稱，可以開啟檔案總管，在磁碟代號前面就可以看到磁碟標籤的名稱。輸入之後按下Enter鍵，就開始進行轉換的工作了。

3. 按下Enter之後，如果畫面上出現詢問你是否要強制卸下磁碟的訊息，表示該磁碟的資料正在使用中，這個時候有兩種處理方式：

(1)先關閉其他所有的應用程式，然後按下Y鍵，再按下Enter即可繼續進行轉換。
(2)按下N鍵再按下Enter鍵，不強制進行卸下磁碟的動作，接著會詢問你是否在下次重新啟動電腦時，進行轉換的動作，按下Y鍵再按下Enter鍵，就可以在重新啟動電腦時進行轉換了。

不過你最好先備份你的重要文件