要看你對一樣不一樣的定義。數位檔案的特性就是復製檔案不失真。

但是這跟『檔案』不失真跟『音質』不一樣，那是兩回事。

直接對燒品質絕對優於APE~
APE-CUE唯一的好處是包留了CDDB而已~^^*
APE最算選BEST也只是跟WAVE一樣的KBPS~

如果你說的「品質」指的是「資料的正確性」的話，APE 壓縮法是「無失真」壓縮法，也就是說經他壓縮後的檔案還原後，得到的 wave 資料，數據會和原來的完全一模一樣，完全沒有差別，就跟用 ZIP/RAR 等無失真壓縮法去壓縮這個檔案是同樣的意思。
所以用 APE 壓縮，在資料的正確性上，是完全沒有損失的，和原始 wav 檔是完全一模一樣的，所以以這個觀點來看，我們可以說 APE 的品質是沒有損失的。
APE 壓縮可以選的 Normal/High/Extra High 等壓縮選項，設定的是壓縮的複雜度，複雜度越高，壓縮率越高，壓出來檔案越小。但是不論是用哪一個複雜度，都一樣是「無失真壓縮」，壓出來和原始檔案都會是完全一模一樣的。就例如說 WinRAR 也有壓縮複雜度的選項，複雜度越高壓縮時間越久，但是不管怎麼壓，RAR 最後還原的時候一定要得到和原來一模一樣的文件，是一樣的意思。

音質不同是Jitter(時基誤差)的問題
Ape是不失真格式實際上使用時還得考慮read/write Offset才是不失真
至於你的問題你參考的文章都說清楚了即使資料正確卻還是存在著Jitter的問題....

多謝各位大大回應!!!
小弟大概知道了~~謝囉~~

會有差別是在抓音軌到硬碟上(.wav)的過程中，
如果這產生的WAVE你聽起來和來源CD一樣，那將它經過APE\FLAC化和解壓縮還原成WAVE是完全一樣的，
不會說轉APE就讓音質劣化，不過也是有人說APE播放起來還是不如WAVE，當然如果你要將APE燒CD，那燒錄過程又是一項變數，

就聆聽感覺來說，CD =>WAVE =>APE\FLAC =>WAVE =>CD，這樣燒出來的CD是有可能和來源CD有差異的，至少信誓旦旦說聽得出差異的大有人在，
不過至少WAVE<=>APE\FLAC這個步驟是不會有任何變數的。

感謝提供，
小弟都一直認為，
cd copy cd就是完全一樣，
原來還是小小的差異。
不過也還好，
小弟是真的聽不出來。XD

我記得以前有套軟體叫做EAC,
他可以去校正cd reader的offset,
達到最佳的音質,
僅供參考

以抓取 CD 上面資料時，讀取的 jitter 對資料正確性來說，有三種結果：
1. 有 jitter，且造成資料錯誤，且資料錯誤無法被修復
2. 有 jitter，且造成資料錯誤，但資料錯誤可以被修復
3. 有 jitter，但狀況在允許範圍內，因此沒有造成錯誤

因為沒有絕對完美的東西，所以與標準來比，總是會有多少不等的 jitter。只是這個 jitter 是否會造成錯誤，與這個錯誤能否被矯正。當然，這裡僅是資料由 CD 讀取的部分，這邊基本上數位或近似數位的傳輸。