讀取 APE 是即時的，不過播放 APE 跟播放 WAV 的過程其實差異不大
播放 WAV：
即時讀取 WAV -> 把 WAV 資料送給音效卡 -> 由音效卡負責輸出

播放 APE：
即時讀取 APE -> 解碼成 WAV -> 把 WAV 資料送給音效卡 -> 由音效卡負責輸出

兩者都是即時讀取，播放 APE 只是比播放 WAV 多了一個解碼的步驟，其他後續的處理完全一樣。
除非系統故障，軟體錯誤，否則解碼過程不會有錯誤，不然系統上同樣執行的其他程式也會發生錯誤。
如果我們做這樣的實驗，把播放 APE 和播放 WAV 時，傳到音效卡上的 WAV 資料再轉回來，存到硬碟，比對這兩個資料，我們會發現播放 APE 和播放 WAV，兩者傳到音效卡上的 WAV 資料都是相同的。
那麼問題來了，對於音效卡來說，前面做了什麼處理與它無關，只要它收到的是一樣的資料，它就應該發出一樣的聲音，那麼為什麼明明資料一樣，聽起來會不一樣？

可能的原因：
1. 心理因素，由於事先主觀認定聲音一定有差別，所以聽起來就有差別
2. 生理因素，由於人的生理情況每剎那都在變化，所以每次聽都會有細微的不同差別
3. 環境因素，同樣的空氣的溫度濕度變化也是時時不同，所以兩次聽起來會有差別
4. 電腦因素，由於播放 APE 需要多一個解碼的過程，CPU 負擔會比較重，也許在這種情況下，音效卡的電源啦、電磁波啦等等電氣的特性會產生微妙的變化，造成發出來的聲音不同

不過以前版上有大大用 RMAA 測試，測試出來播放 APE 和播放 WAV 兩者在 THD+N, S/N, Dynamic Range 等項目上，數據沒有什麼差別，所以小弟個人認為，播放 APE 和 WAV 兩者即使有差，差距應該也相當小，和系統電源、線材、喇叭本身的音質、墊材、空間環境等其他因素造成的影響相比，應該是非常非常小的。