許多用戶與企業在安裝Windows XP SP2後發現問題叢生。在發佈SP2前的幾個月，微軟就已經不斷營造氣氛，指出SP2因為安全限制較多，有可能會對某些安裝產生影響。
然而，自從8月初XP SP2發佈後，安裝SP2引發的相容問題層出不窮，使人感到震驚和沮喪。以下讓我們就來看看部分容易引發問題的地方。
已知問題
微軟發佈SP2之後，很快又發佈了Knowledge Base Article 842242，文中指出，「安裝SP2會導致一些程式停止工作」。文中還列出了SP2下不能正常工作的軟體清單。
因為這次升級的下載檔案龐大，因此你可能會想考慮關閉自動更新功能(或至少設為「下載更新前請先通知我」)，或否開始下載更新檔時你的網路效能可能受影響。Windows XP家庭版自動升級到SP2需要下載80MB資料，自動升級從8月18日開始。微軟推遲了Windows XP專業版的自動升級。用戶如果還沒準備好，那他們有足夠的時間可暫時先關閉自動升級功能。
以下問題是安裝了SP2的用戶曾碰上的問題：
部分FTP軟體無法啟動。
串流媒體應用程式時好時壞。
部分e-mail軟體不能正確升級和顯示新郵件。
一些與伺服器有關的問題（當執行伺服器功能時），包括無法正確識別或回應用戶端的請求。IIS服務、文件共享和遠端桌面功能也會有問題。
一個已知的問題是：Microsoft Business Solutions CRM Sales for Outlook 1.2需要安裝修補檔。
Microsoft L2TP用戶端使用NAT方式連接伺服器時會出現問題。
有不少問題出現在多人對打網路遊戲和即時傳訊軟體，幸好這不會影響到大多數商業用戶。
德國安全公司Heise Security發現SP2中的漏洞，並認為這些漏洞將使病毒和蠕蟲給Windows帶來巨大破壞。
XP防火牆問題
目前，很多問題和預設啟動的Windows防火牆有關（也被稱作網路連接內建防火牆，ICF）。如果ICF不能直接處理新的應用程式，解決方法是重新設定ICF以使其接受應用程式或手動開啟特殊埠。微軟專門發佈了Knowledge Base Article（875357），介紹了XP SP2中與ICF相關的問題，以及如何解決這些問題。
一些管理員可能乾脆關閉ICF。在大多數公司設定中，通常已經安裝網路防火牆，所以他們不需要ICF了。然而，對於那些沒用防火牆的遠端用戶、分支機搆和小企業來說，應該考慮使用ICF，否則他們就只能把安全改善寄託在SP2上。
如果你夠幸運的話，當你執行一個還沒有設定能相容於防火牆的應用程式時，ICF會跳出警示。這是Windows防火牆安全警告（Firewall Security Alert，FSA）功能，可讓你快速解開該應用程式的阻擋。這個動作僅需作一次，以後就不會再碰上問題。
如果系統沒有彈出FSA對話方塊，你就必須決定應打開哪個埠，並重新手動設定ICF以識別程式。微軟提供了如下指南以對ICF進行設定：
點選「開始|執行」，輸入wscui.cpl。
點選Windows防火牆。
點選Exceptions(例外)頁面，並選擇Add Program(新增程式)。
從清單中選擇相應的程式，點選OK，然後確認在Exceptions對話方塊中列出的程式有被選起來。
我建議你將手動增加的程式製作一個列表，以便你遇到其他應用程式出現問題時，可再把這些程式拿掉，重新選擇。如果你可以透過這個方法修正問題，你就不需要瞭解更多的技術細節，如程式使用的埠等等。ICF可以進行自動管理，打開或關閉相應的埠，因此增加了安全性。
如果FSA對話方塊和手動程式設定都不能解決問題，或者該程式名稱根本就沒出現在Exceptions頁面中。你就必須手動設定防火牆了。要做到這點，用戶需要瞭解哪個程式使用哪個埠。
若要手動進行通訊埠設定：
執行wscui.cpl，打開Windows防火牆。
進入Exceptions頁面中的Add Port選項，鍵入埠號、確定其為TCP或UDP，並為其起名。
點選Exceptions頁面，檢查新服務是否已加入。你仍然需要檢查服務後面的選擇框是否被勾選。，
如果你不知道埠，並且不能從供應商的文件中直接查到，你就必須在程式正常執行過程中對程式狀態進行監視。
微軟建議讀者使用netstat -ano > netstat.txt命令監視應用程式。參數a列寫了所有監聽的埠和連接；參數n列寫了埠號；參數o可以識別哪個程式正在使用哪個埠；所有被捕捉到的結果將被寫入「netstat.txt」文件。Tasklist可以顯示流程辨識器；服務方便則使用tasklist /svc。
據微軟KBA 875357所述，下列程式可能需要你重新設定ICF埠和許可權才能正確執行。但這並不是完全列表，只包括用戶經常遇到的程式：
Microsoft Visual Studio.NET
Microsoft SQL Server 2000a（ports 1433 and 1434）
Microsoft SMS 2003 Server（TCP 2701）
Microsoft Operations Manager 2000 SP1
Microsoft SNA 4.0 SP3
Attachmate KEA! 340 5.1
Attachmate Extra! Personal Client 6.5 and 6.7（port 23）
Attachmate Extra! Enterprise 2000（port 23）
Attachmate Extra! Bundle for TCP.IP 6.6（port 23）
Autodesk AutoCAD 2000（port 21）
Autodesk AutoCAD 2002（port 21）
Autodesk AutoCAD 2004（port 21）
Computer Associates ARCserve
Computer Associates eTrust 6.0.100 and 7.0
Macromedia ColdFusion MX SE 6（port 8500）
NetManage ViewNow 1.0 and 1.05
Veritas Backup Exec 9（port 10000），Exec 9.1.4691（see documentation），and Volume Manager 3.1（port 2148）
Symantec Ghost Server Corporate Edition 7.5 and AntiVirus Corporate Edition 8.0 and 9.0
結語
根據2004年8月24日，SANS（System Administration Networking and Security Institute，SANS Institute）網路調查顯示：46%的用戶反映安裝XP SP2後沒有出現問題；27%的用戶出現小問題；8%的用戶問題很大，但是他們可以自己修復；還有8%的用戶出現嚴重問題但是無法自行修復；7%的用戶不得不重裝系統。最棘手的是那些不能進入安全模式修復而必須重裝系統的7%用戶，雖然只是7%的情形，但以全球規模來看，數量其實相當龐大。
用戶必須預期，安裝新防火牆軟體後，跟部分軟體相衝是正常的，這些應用程式包括用戶端的查詢和用戶端軟體，以及必須從伺服器上獲取資料的應用。這算是正常現象。這些問題對於大多數網路管理員來說是容易解決的，由於他們的網路已經有了網路防火牆，所以只需關閉ICF就行了。同樣，管理員可以查看他們正在使用的防火牆設定，然後使用這些埠設定來設定公司防火牆之外的工作站或筆記電腦。
XP SP2在安全方面最顯著的（也是直接影響系統管理員的）改進是：透過升級可以阻擋絕大多數蠕蟲引發的緩衝區溢出（buffer overruns）。但是，先別高興得太早。這個進展還需要依靠No eXecute（NX）功能。NX可以防止任何程式碼在被保護的記憶體區域中執行。這意味著，緩衝區溢出仍然會出現，但是惡意程式會被移至一個不會對系統造成任何傷害的記憶體區域進行。
問題是現在多數CPU不支援NX命令，實際上只有最新的AMD晶片和一些Intel Itanium伺服器的晶片支援這個功能。目前，為XP系統增加NX功能來提高安全性，理論面大於實際面，但如果NX被更多的晶片所採用，在下次你升級系統時將會有重大影響。
另一需要記住的是，ICF的過濾只是在流量進入系統時發生。但對於像按鍵側錄（keystroke logging）這類的惡意軟體，它從你的系統向外發送報告，ICF的過濾就無能為力了。