您這個問題我也遇過,也花了很多時間去找答案,結論是無解,因為實在很難控制累積的誤差的增加量,到底是多少,只能邊看邊修正,不過實在是太麻煩了,後來就放棄了.

第一句先同步

然後要調字幕的 frame rate 調到跟影片一樣就可以了

這樣就可以完全同步了

1.樓主說的是影音同步問題，和字幕沒有關係吧
2.樓主並未說明是用那一個軟體轉檔，很難幫上忙
3.依內容推測，樓主的影片應該是上下兩部，且分開轉檔
4.建議先合成一片avi再來轉，影音不同步通常是frame錯誤造成，如果avi的影音同步，但轉檔後卻出現錯誤，八成是轉檔的步驟有誤。

用GoldWave調整音訊檔案，
例如：可以把61分20秒的音訊檔案，調成60分05秒。
調成多少可以自訂，不過時間差太多可能音調會變調。

另外：影音不同步有可能影像缺幅造成的，
就算把音訊長度改的跟影像長度一樣，轉出來可能還是會有問題。

比較推薦把影片分段，例如你的影片有60分，就大概切成6段，
然後一次調整一段，把音訊調至符合影像的位置，
依序調好6段影片
最後6段正常的影音檔，再組合成一段影片。