建議先找電池供應商確認充飽電壓是否真的是40V 畢竟這是問題的源頭。
順便分享去年碰過的慘案：

因為開車怕熱而貼了較暗的隔熱紙，結果老車大燈不夠亮，又花錢去裝HID霧燈，
因為 55W*2 霧燈太耗電，結果鉛酸電瓶被榨乾死過一次，故又花錢去換鋰鐵電池，
網拍賣家很熱心地賣我新款採用鈦酸鋇鋰電芯的電池，結果才一週沒開車就花不動，
ㄌㄨ了老半天才要到一張電芯充放電曲線圖，看過後差點挫屎：
原來電芯充飽電壓超過2.5V，六串則為15V，而汽車發電機於熱車後大約只有13.6V，
難怪電量很快就被榨乾，因為永遠都充不飽，
最後拜託賣家換另一顆採用舊款（充飽電壓較低，數值不明）電芯的電瓶才解決。



假設樓主的LiFePo4電芯充放電曲線跟上圖相似，且電池是18串的36V，
電芯2.4V時，電池為43.2V，電量約為80%，
電芯2.3V時，電池為41.4V，電量約為50%，
電芯2.2V時，電池為39.6V，電量約為30%，
萬一充電器的充飽截止電壓設為類似鉛酸電瓶的40V，那就能合理解釋樓主碰到的現象了。

加減參考，若有謬誤之處也請各位大大不吝幫忙糾正