FAT32和NTFS是兩種不同的檔案結構，
Windows 95 OSR2以及Windows 98使用的是FAT32，
而Windows 2000及Windows XP則可以使用NTFS，
NTFS相較於FAT32之下，
NTFS的資料密度比較集中，不像FAT32這麼地容易分散，
相對的效能也就比較高，
而且NTFS對於資料的保密方面有著較完善的方式，
這也是FAT32所比不上的。

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