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一連串的恐怖事件肇始於兩架遭挾持的客機，以自殺式方式撞擊美國世貿大樓，接著美國五角大廈、國會山莊也受到攻擊，美國進入備戰，以下是整個恐怖事件的時間總整理：（美東時間11日為上午8時45分，台北時間11日晚間8時27分，第一起飛機撞擊世貿南棟大樓，，以下時間均為美國時間）

0845　紐約世貿大樓北棟大樓遭第一架飛機撞擊（美航編號11波士頓飛洛杉磯班機，機上有92人）
0903　紐約世貿大樓南棟大樓遭第二架飛機撞擊〔美航編號77華盛頓飛洛杉磯班機，機上有64人〕
0920　布希總統佛州發表第一次談話
0940　美國宣佈機場關閉7小時
0945　國防部五角大廈遭到一架自殺飛機攻擊
0957　布希搭乘空軍一號飛往路易西安娜空軍基地
1000　世貿大樓南棟倒塌
1010　五角大廈部分建築倒塌
1022　國務院遭到自殺汽車炸彈攻擊
1025　美國民航機遭挾持
1028　世貿北棟大樓倒塌
1048　賓州遭挾持民航機墜毀〔聯航編號93新澤西州紐沃克飛舊金山班機，墜毀於賓州匹玆堡東南方130公里處，機上有45人〕
1057　紐約州機場關閉
1100　紐約州長朱力安尼記者會
1104　聯合國撤離
1118　兩架遭挾持民航機墜毀