不知道你是不是指 Win98 內建的
Fdisk.exe 及 Format.com 不支援 64GB 以上硬碟？
這是因為這兩個程式內部使用了舊 16-bit 模式，
導致硬碟容量回報錯誤。
微軟有提供了修正版的 Fdisk.exe 及 Format.com 下載。

另外你也可以改用 SPFDisk 這個免費軟體，
它綜合了 FDisk 及 Boot Manager 的功能，
可以讓你規劃多重作業系統。