结局一：（我们看到的国语版）
仁被大B打死，刘德华走入电梯杀了大B。
电梯门开，吴廷烨上前：“刘健明，你被怀疑是黑社会卧底，我们现在要拘捕你。”
刘健明交给他警员证，被戴上手拷，音乐声起……

结局二：（粤语版本，只在香港首映式上放映，估计要等三区正版DVD才会有这个片段）
电梯门开了，
一只手高高举起刘建明的警证。
刘建明面对枪口走出来，坦然地说了四个字：“我是警察。”
警察冲进电梯，刘建明不动声色，从容地把警证别在胸前。回头看着陈永仁还没来得及闭上的眼睛里不甘的神情。

而陈永仁的身份终于在死后被证实，在墓地举行庄严的仪式上。大家都为他而惋惜。
刘建明一身高级警官的制服，英气逼人，还有谁能想道他曾经是黑社会的卧底？

面对梁的墓碑，他站定，敬礼。
刘健明在墓碑前敬礼，眼神里幷没有丝毫的得意。他看到的是一个曾经和自己一样身处无间地狱的人，只有陈永仁才最能了解是非难辨，身份错乱的痛苦。他之于刘健明仿佛是一位真正的知己。不同的是，陈永仁在死后才恢复了身份，得到了最后的解脱。
刘健明的眼神里有惋惜，感慨，更多的是敬佩，还有做回一个好人的决心。他已经得到解脱了吗？也许身份不会被发现，但心里的阴影让他的眼神永远少了一分清澈。
影片的最后回到陈永仁离开警校的时候：
黑白色的陈永仁少年时代，
彩色的梁朝伟，无奈的一笑，从此踏上无间道；
警官大声训话：“谁不服从就是这个下场，驱逐出校，谁愿意跟他换？！”
黑白色的刘健明少年时代，
彩色的刘德华，望着梁朝伟离去的背影，内心痛苦地挣扎着，却同样身不由己。画外音：“我愿意跟你换。”



這是在別的網站轉貼的....不知道有無違規...個人覺得第二個結局好多了