4月20日晚，英國《自然》雜志網站發布了2016年度自然指數排名（Nature Index 2016 Tables），中國科學院在全球科研機構排名中繼續位列第一。在國家和地區排名中，中國是全球第二大高質量科研論文貢獻國。雖然仍排在美國之後，但在前10名中分值增幅最大。在前十中，只有中國在2012至2015年間呈現出兩位數的年均增長率（13%）。

在全球科研機構排名中，中科院以1357.82分繼續蟬聯榜首，這一分值幾乎比排名第二的美國哈佛大學（772.33分）多出一倍，法國國家科研中 心排名第三。但從整體來看，歐美等傳統科研強勢地區仍然優勢明顯。除中科院和排名第六的東京大學外，前10名的科研機構中另外8所全部來自歐美。

此外，在《自然》列出的四大核心學科排名中，中科院在物理、化學、地球與環境科學3個專業排名全球第一。但在生命科學領域，中國科研機構排名普遍較低，除中科院位居第九外，沒有其他機構躋身前50位。

此前，《自然》執行主編暨自然出版集團大中華地區總監尼克·坎貝爾曾表示，中國高質量科研產出的持續增長令人印象深刻。從這些數字可以清楚地看到，世界上有越來越多最好的研究是在中國發起、主導和完成的。」

最新發布的2016年度排名，通過加權分數式計量（weighted fractional count，WFC），對全球科研機構、國家和地區、核心學科、高校及企業等在去年全年的表現分別進行了評估。WFC指數主要以論文發表為標准，同時考慮了不同學科之間的權衡問題，能較全面地反映論文作者、機構和國家對全球科學的貢獻。此次發布的2016全球自然指數涵蓋了2015年1月1日至12月31日發表在68種世界一流科研期刊上的論文。

排名前十位的院校研究機構分別是中國科學院、美國哈佛大學、法國國家科學研究中心、德國馬克斯·普朗克研究所、美國斯坦福大學、日本東京大學、美國麻省理工學院、德國亥姆霍茲國家研究中心聯合會、英國牛津大學和英國劍橋大學。

11至20位的是美國加州大學伯克利分校、美國國家衛生研究院、瑞士蘇黎世聯邦理工學院、美國加州大學聖戈分校、美國密歇根州立大學、中國北京大學、美國耶魯大學、加拿大多倫多大學、日本京都大學和美國加州大學洛杉磯分校。

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