電影還沒看，而且估計兩天之後才能看到...
不過就樓主的疑問，我想我基於對原著的理解能回答一二.
一. 金剛狼的能力不是永生而是超強的復原能力，這兩點是不一樣的，所以金剛狼會老化，老化到一定程度一樣會死. (外傳如Old Man Logan都有這個梗)
二. Adamantium的設定是很詭異的，記不記得Wolverine Origins, 上校命令Deadpool砍下金剛狼的頭. Deadpool的刀也是Adamantium啊! 官方還有若干粉絲在MARVEL論壇腦補之後的結論是同樣是Adamantium金屬還是有密度，厚度，跟承受力之分，所以Adamantium刀砍斷金剛狼的Adamantium骨架是有可能的, 畢竟他骨骼上只是一層薄薄的Adamantium coating.
三. 萬磁王跟X教授在中年之後一向是亦敵亦友，在變種人面臨生死存亡的時候還是會攜手合作的. 就我所知，這系列電影的下一集是依據Days of Future Past改編的，反正就是X教授夢到了來自千年後的大敵會來滅亡變種人所以必須爭取所有能夠爭取到的變種人力量反抗. 另外萬磁王能力恢復的問題，上面網兄已經提到了.