比較安全的作法是分兩顆硬碟
且安裝時另一顆硬碟不要接上 這是最保險的

若是同一顆硬碟的不同的partition 因為安裝程式看的到另一partition內容
不確定會不會有問題....且這就要多重開機了,且會互相干擾

若真的只有一顆硬碟..我的作法會是
先裝好OS在第一個partition,將此partition ID改掉,讓Windows 認不出來
再將另一個OS裝在第2個...之後將第一個partition 的 ID還原
這種做法不需要多重開機...
要啟動另一個OS,把該 partition 設定 Active 重開機即可