NTFS的存取控制權是針對使用者帳號
你的狀況要從win2003去設定相對應的帳號控制才行

同一個使用者帳號可以從不同電腦同時登入win2003主機
只是拿到的權限都是相同的
不符你的需求
只要把各別帳號設定出來就不會混在一起