經濟部智慧財產局表示，原民會於9月15日表示，「賽德克．巴萊」具有深層文化意義與族群認同功能的原住民族群文化表現，是「原住民族傳統智慧創作保護條例」所保護的客體，不應登記為商標，因此該局尊重原民會意見，將依商標法提請評定程序撤銷果子電影有限公司有關「賽德克．巴萊」商標之註冊。另南投縣信義鄉農會尚在申請中之商標，亦會不准其註冊。