下面是小妹的經驗談 可以參考一下

１、如果自由行的套裝行程有附利木津的巴士票的話，建議在第一天就使用。因為巴士是直接送你到飯店，可以省掉你拖著行李找飯店的時間。
　　池袋站在太陽王子飯店的出口沒有電梯或手扶梯，會讓你搬行李搬到想哭
　　華盛頓飯店離新宿站有點距離，不過車站出來就有百元的巴士可以直接送你到飯店
　　而且利木津巴士在東京的各大飯店都有到，你只要在出關的時候到機場裡的櫃檯拿票去換乘車卷就可以。

２、飯店的選擇的話，就要看你們夫妻喜好而定。如果不知道要去哪邊在飯店附近逛逛也是不錯的選擇
　　池袋站出來的店基本上都是動畫、漫畫居多，有名的乙女路就是在要去太陽王子飯店的路上。
　　新宿站的話就是百貨公司聚集的點了，附近的百貨公司超多，還有可以買電器用品的專門店。
　　太陽王子飯店小妹沒住過，但據網路上的評價是房間是蠻小的。
　　華盛頓飯店的話舊館的房間比較大，新館的房間則是比較小的，小妹上次去華盛頓飯店的櫃檯有個台灣去的小姐，會講中文而且她還撒必斯的給了我們超大的邊間。
　　PS：我們住的是舊館。

３、吉卜力美術館的入場是有時段的，但是沒有限制在美術館裡面的時間，而且你必須先在台灣買好票，到了門口可以找工作人員換入場卷，去到日本是不可能買得到票。
　　尤其樓主又是選擇禮拜天的早上，請務必提早到場，不然會讓你排隊排到天荒地老才能進去。小妹上次去已經是提早半小時到了，而且我們去的那天還是禮拜四，但是等到開門以後還是排隊排了將近一個小時才進場。
　　不過他們已經換了新的入場方式，每個時段的入場時間只有半個小時，早上１０點沒有入場的話，就要等到１２點了。
　　入場卷可以換得免費看一次美術館裡面才播放的小動畫，不用擔心聽不懂日文，專心看就會懂。
　　美術館裡面是禁止攝影、拍照的，他是希望參觀者能把看到的記在心裡面，而不是一直拍照，忽略掉美術館裡面的美好事物。
　　參觀完以後可以到旁邊的井之頭公園休息兼野餐，回程可以順便去下北澤，據說下北澤有很多賣東西的小店，但是小妹沒去過，無法提供評價。

４、台場能不能耗掉一天還是要看你們夫妻的喜好，台場大部分都是展示中心或大型商場，喜歡的人可以逛一整天，不喜歡的人一眼就逛完了。
　　早上可以先去築地，然後再去汐留的都路里吃抹茶聖代再去搭百合海鷗號到台場就差不多花掉一天時間了

５、上野的話也有很多地方可以逛，像是去阿美橫町的ＯＳ藥妝店、還有隔壁站的御徒町的多慶屋土產超便宜，可以買回來做人情又不會大失血、上野恩賜公園也是不錯的地方。
　　有去上野的話，還可以順便去淺草逛逛，去淺草有名的炸蝦店吃個美食也不錯。

６、地鐵的車票的話不建議買一日卷，不一定划算，建議要去哪邊再買票就好。可以選擇西瓜卡，不過西瓜卡好像有限制某些線是不能坐的，這個小妹不清楚，還是請樓主參考他人的遊記。

　　以上。
　　給樓主參考，不過這已經是幾年前去東京的經驗了，不知道資訊正不正確。
　　小妹覺得行程可以排得緊密一點，但是不用強迫一定要走完，自由行就是要輕輕鬆鬆的順著自己的步調，走不完的行程就算了，就當作下次有機會再來。
　　而且去東京一定要先練一下腳力，到東京的第一天請先去買休足時間，小妹兩次去東京都是靠這個活過來的，日本人的腳力真的不是台灣人能比的。