我似乎跟樓主碰到同樣的問題。主機板一樣，硬碟是 WD 6400AAKS,
不過是第二顆。系統碟是 Seagate, 跟機器用了一年多，一切正常。
前兩天買了 AAKS, 剛裝上去時一切看似正常。
沒想到今天要來 copy files 到新的 WD 硬碟，出問題了。
我 copy 大檔案，一開始還正常，後來就突然卡住，變得很慢很慢。
CPU 拉高到 50% (我是雙核心機器).
既使取消重新 copy 也不行。
事件檢視器有
驅動程式在 \Device\Harddisk1\D 上偵測到控制器錯誤。

不知道樓主後來解決了沒？