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2007年
　　　　
　　　　基於仇恨的驅使，Ben、Richard和Jacob回到了1996年殺掉了島上所有的DHARMA組織成員。然後他們發現有一些DHARMA組織的成員並不在小島上(Penny的父親)，The Others必須想辦法不讓其他成員重新回到這個小島搞垮他們。於是基於隱藏小島不被外界發現和找到的目的，Ben把這個小島放進了一個時間循環中，這個時間循環將讓這個小島停留在過去（1996年），來使其他的DHARMA組織成員不能來到這個小島。在實現這個時間循環後，Ben和Richard把島上的剩餘居民聚在了一起，就形成了對抗DHARMA的組織"The Others"。
　　　　
　　　　為了創造這個時間循環，Ben和Richard把時間機器從ARROW工作站偷偷轉移到了SWAN工作站，在工程師Mikhail的幫助下，他們得以把時間機器用水泥深深藏在了SWAN工作站的最深處。然後，Mikhail調校了時間機器和圍繞著小島的磁場，實現了把整個小島放入時間機器的可能。匆忙中他們完成了一個維持時間循環的電腦系統，這個電腦系統需要每108分鐘激活一次，每次激活等於激活了一次時間機器。所以，外面的真實世界的時間還在照常流逝，而小島上的時間則一直停留在1996年，直到2004年的飛機墜毀。唯一能夠從真實世界的時間進入到小島的時間的方法，就是通過那個在第4季出現的特殊的坐標。在第3季中Ben曾經對Richard說過："還記得我們曾經慶祝過生日？"，所以如果The Others的時間永遠在108分鐘之間循環，那麼他們沒有任何可能來慶祝生日。

1996-1996年（島上時間停留的8年）
　　　　
　　　　小島上的時間停留在了108分鐘之內，The Others和小島等於在這個世界上隱形了，The Others繼續對時間機器的研究。The Others想要在這個小島上建立一個新世界，他們想讓這個小島永遠停留在這個時間循環中，他們認為只要時間永遠停留不變，命運的規則就不會起作用。但是，有一個問題出現了，隨著時間的靜止，島上的所有孕婦和孩子都會被命運殺死，The Others需要想一個辦法能夠在島上創造生命。於是他們把Juliet請到了島上解決這個問題，同時也找了一個軍官Kelvin來激活時間機器，並讓他相信他是在拯救世界，同時島上的所有人都不會變老。
　　　　
　　　　因為小島對於真實世界來說是不存在的，所以Ben和Richard必須要嚴格控制所有進島和出島的人員。另外，你必須要通過Black Rock在幾百年前創造的特殊通道才能離開和進入小島。如果你沒有通過那個特殊的坐標離開小島，那麼等於你是從過去的世界進入到了現在的世界，你必須要找到一個在這兩個世界中都存在的不變的常量才能夠生存（Desmond找到了Penny）。同樣如果你從島外進入到島內，而且沒有通過特殊坐標的話，你的思想就會停留在現在的時間和小島上的過去的時間之間，同樣你想存活下來的話你就必須找到那個常量。
　　　　
　　　　Jacob也是和Ben和Richard一樣進行了時間穿梭，但是我們並沒有見過他的實體。在這三人通過時間穿梭回到過去，並進行時間循環的過程中，Jacob因為某種原因死去了，但是實際上在島上現在的這個時間，直到2007年他們時空穿梭在1996年之前，Jacob都是活著的，所以Jacob並沒有完全死去，他的靈魂還活著，並且還可以和Ben和Richard溝通。
　　　　
　　　　1996-2004年（原來的時間線）
　　　　
　　　　因為島上的時間停留在了1996年，所以所有的Lost的主要角色的生活都通過回憶展現，我們通過這些1996-2004年之間的生活片段瞭解了這些角色。一旦這些人物從島上逃了出去，他們將會重新經歷一遍這8年生活，就像我們在第3季結局看到的Jack所在的未來。
　　　　
　　　　1996年（島上的時間，大約是現在的世界的2001年）
　　　　
　　　　Juliet被聘請到了小島上來幫助解決孕婦生孩子的問題。Juliet是一個真誠的好人，所以她會為了救她的妹妹做任何事情。到了島上之後她並沒有注意到島上的時間不會改變，Ben也想方設法把她留在島上。Richard和Ethan通過特殊坐標離開了小島，回到了大約5年前(即1996年)，來完成徵召的任務。因為Ben是來自未來，所以他知道Juliet的丈夫被車撞死的準確時間，於是他就叫Richard和Ethan在這次事件之前的幾天去聯繫Juliet，因為那是能說服Juliet來到島上的最好時機。另外，Ben也知道Juliet的妹妹的癌症最終會被治好，這就是為什麼Ben可以那麼肯定的對Juliet說只要她來到島上他就可以治好她的妹妹。
　　　　
　　　　1996年（島上的時間，大約是現在的世界的2001年）
　　　　
　　　　Witmore，Penny的老爸，DHARMA的主要成員之一，在一個拍賣會上得到了Black Rock的航海日誌，從而得到了能夠安全進出小島的特殊坐標。Witmore僱傭了Libby的丈夫作為第一個去小島的實驗品，他給了Libby的丈夫一艘船及能夠抵達小島的坐標，結果Libby的丈夫意外死去了。後來Desmond得到了船以及坐標，但是不確定是Witmore估計想把他弄走所以給的他，還是Desmond就碰巧得到的。
　　　　
　　　　迷失Lost的時間穿梭理論大揭秘 - 第三部分：
　　　　
　　　　2004年（現在的世界）
　　　　
　　　　Oceanic 815墜毀在了小島上。因為Desmond沒有按下按鈕，沒有在108分鐘內激活能平衡島上的磁力的機器，結果產生了巨大的磁場把Oceanic 815撕裂成了兩半，一半在磁場內也就是8年前1996年，一半在磁場外也就是2004年。在這裡有兩個巨大的疑問：是否是命運安排Oceanic 815墜毀在了這個小島上，來讓Locke成為繼續去按那個按鈕的人，還是DHARMA組織特意安排的在飛機接近小島時發生的此事，因為他們知道這架飛機的倖存者將會停止島上的時間機器？這也是Lost的最開始的問題，墜機的倖存者是被命運安排到了小島上的，還是DHARMA精心策劃的讓這些人來到小島的？或者是這兩種可能都有一部分？

在飛機墜毀後，我們的倖存者從2004年來到了1996年，他們的身體恢復到了1996年的狀態，所以Locke被治癒了因為1996年他還沒有癱瘓，同樣Rose的癌症也被治癒了。
　　　　
　　　　1996年（島上的時間）
　　　　
　　　　Lost前2季都發生在時間停止的這一段時間。Locke找到了地下的工作站，停止了繼續按按鈕，等於停止了時間機器的繼續工作，於是Desmond啟動了安全保險裝置。結果安全保險裝置毀滅了整個時間機器，之後島上的時間開始正常進行，不再是以前停止的狀態，實際上安全保險裝置的真正作用是把時間重設在初始值，即1996年，現在這個島上的時間要比現在的世界晚大約8-9年。當Desmond用鑰匙啟動那個裝置時，他的整個人生在他的眼前閃過，他等於重新又活了9年。他看到了Charlie的死，他看到他離開了小島後重新開始生活，遇到了Penny，然後發生了很多事後最終又來到了這個小島，回到了1996年，然後又重新開始這9年的故事的循環。
　　　　
　　　　Desmond無法逃脫命運，之所以Desmond要重新活這9年，是因為他是那個轉動鑰匙的人，或者說他在時間機器的心臟部位，所以他有了看到自己曾經的生活的能力，這也是為什麼他可以預見Charlie的死。誰知道Desmond究竟重新活了多少個9年，每次活一遍他都能看到Charlie是如何把信號發出島外的，以及墜機的倖存者是如何離開這個小島的。
　　　　
　　　　2007年（現在的世界）
　　　　
　　　　Oceanic 815的墜機殘骸在原來的世界的海底被找到。DHARMA組織和Naomi知道飛機在2004年失蹤後，就把Naomi用島外的時間機器送回到了2004年，Naomi在2004年組建了一個團隊到了島上去找Ben，她的團隊的任務還包括把墜機的倖存者轉移到大海上的船上，這樣他們就能在2007年被找到。
　　　　
　　　　1996年（島上的時間）
　　　　
　　　　在倖存者們破壞了屏蔽島上信號的設備，Desmond成功的幫助Charlie完成使命把信號送到島外後，Jack可以使用Naomi的設備和貨船進行通話。她的設備是DHARMA特別製作的特殊設備，這個設備可以讓Naomi在過去和未來的DHARMA通話，甚至Sayid注意到這個設備有多先進，因為它是用來和不同的時間通話的。
　　　　
　　　　Daniel讓他的團隊在貨船上啟動了一個負載測試裝置，這個裝置用來測試允許自由出入小島的特殊的坐標。如果這個裝置遠遠偏離了特殊坐標，那麼他的信號可能要8年後才會被在島上的Daniel收到。而實際這個裝置發出的信號只用了31分鐘就被Daniel收到了，說明他們已經離那個特殊坐標非常近了。關於Naomi團隊的動機，他們是為DHARMA組織工作的，他們很不高興，他們是來抓Ben的，因為想知道小島上的DHARMA組織是怎麼消失的。
　　　　
　　　　1996年（Desmond的時間線）
　　　　
　　　　Sayid和Desmond成功離開了小島，他們穿過了小島和現在世界的時間屏障，換句話說他們實際從1996年來到了2004年。只有Desmond受到了時間變化的影響，因為他曾經在SWAN工作站呆過3-4年暴露在高強度的輻射下。當Desmond穿越時空時，他回到了最開始的原來的1996年時間線，而Daniel非常清楚在Desmond身上發生了什麼，所以他使用了他的通話設備和2004年的Desmond通話，叫他去找一個不變的常量才能最終拯救自己。當Desmond在1996年和Daniel見面時，Desmond就成了Daniel穿越時空的不變的常量，這就是為什麼當Daniel在島上重新看自己的日誌時發現了新寫上去的東西，內容是"Desmond就是他的常量"。Daniel並沒有因為叫1996年的Desmond去找他而改變了歷史，他只是在搞清他自己如何離開小島並回到2004年。
　　　　
　　　　不幸的是，Daniel、Naomi以及其它團隊的成員，都是作為實驗對像被DHARMA組織挑選出來的，我們在他們的回憶中也可以看出來，他們可能知道很多關於DHARMA的事情，他們是可以可以被犧牲的。
　　　　
　　　　至於在貨船上有和Desmond同樣症狀的那個人，他曾經企圖來到小島上，但是沒有經過特殊坐標，結果他從2004年來到了1996年，而且他沒有一個不變的常量可以讓他的思想在兩種時間線中穿越，最後他死了。所以，想抵達小島的唯一方式就是通過特殊坐標，這樣才能讓人類正常的穿越兩條時間線。
　　　　
　　　　1996年（島上的時間）
　　　　
　　　　島上的一些設備被破壞後，六個倖存者最終得以離開了小島，他們是：Jack、Kate、Hurley、Aaron、Sun和Sayid(這個名單有可能最終會有變化)。DHARMA組織在現在的世界的2005年帶著這6個人離開了小島回到了現實世界，而剩下的人則繼續留在了島上，即1996年。但是，不管是DHARMA還是Ben都沒有告訴這6個人他們在島上實際是生活在1996年的。這6位倖存者是在2005年回到現在的世界的，不是飛機的殘骸被找到的2007年，所以實際在找到飛機的殘骸前先出現了6位倖存者。
　　　　
　　　　2005年除了6位倖存者，Ben也離開了小島，別忘了Ben是從2007年穿梭時空回到1996年的。Ben離開小島後，他利用Sayid來幫助他保證到了2007年時事情是按照他的計劃進行的。我們並不知道為什麼Sayid要幫助Ben殺人，但是似乎Sayid要按特定的順序來殺掉這7年些人來保證新的時間線正常進行，他殺的這些人應該都是DHARMA組織的成員。而當Ben把他們都殺光後，他會再次毀掉DHARMA組織，並奪走他們的時間機器，這樣他就可以再次穿梭時空到1996年，再次回到小島，然後重新啟動時間循環系統。
　　　　
　　　　2008年
　　　　
　　　　Jack在離開小島後在新的時間線又生活了3-4年，他知道了島上的人原來一直生活在1996年(現在是1999年左右)，所以他決定做任何事情來測試自己的命運。他決定從一個橋上跳下去，只是想看看命運會不會拯救自己，是不是命運希望他再回到小島上。後來他在報紙上讀到Ben死了，也許這是一個非常好的機會重新回到島上，假設之前Ben一直不想Jack再回到島上。值得注意的是，Jack和其他倖存者在島上生活時並不知道自己穿梭了時間生活在了過去，但是他們還活著是在測試命運，實際他們都應該在幾年前的Oceanic 815墜機事件中死去。
　　　　
　　　　這部劇最後可能會以倖存者是否能夠按照自己的意願克服不可能的障礙來控制自己的命運而結束，而這個障礙是什麼？只有時間會告訴我們。