參考資料

界內球未觸及內野手（包括投手）前或未通過內野手（投手除外）前，被跑壘員於界內區觸及，此時成為比賽停止球，除因擊球員成為跑壘員而發生向前進壘義務外，不能得分及進壘。



未觸及野手（包括投手）之界內球，在界內區觸及跑壘員時，但跑壘員雖觸及界內球，如有下列情形之一者不得僅以與球接觸為理由而被判出局。
　　　(1)已觸及內野手（包括投手）之界內球。
　　　(2)界內球未觸及內野手（投手除外），但已通過該野手之股間或身旁，立即觸及於其後之跑壘員，且任何野手對該球均無守備機會時，但內野手失去守備機會之擊球（不論是否觸及內野手），經裁判員認定故意踢開者，對該跑壘員以妨礙為理由宣判出局。（參考5.09(F)、7.08(F)）
　【妨礙之罰則】跑壘員應出局，形成比賽停止球。


所以你假設Youkilis的那個狀況.....只要跑者沒觸碰到壘包就碰到球......
那就算是出局.....如果碰到壘包而且身體沒離開的話是沒有出局......

以假設的問題來說......只要佔據壘包以後....跑者摸著或站在壘包上....
球直接打在跑者身上.....是不會「出局」.....不過跑者會受傷XD
只是這個問題發生的機率比較低啦.....不過出現機率比較高的時機...
應該是跑帶打....很有可能很巧跑者剛好跑到球打去的方向.....

另外盜壘時.....捕手傳球打在跑者身上......是不算出局......
一定要野手接到觸殺才算......

至於你最後的問題.....上面已經回答.....
三壘跑者不會站在線內.....一定是站在線旁邊的區域.....
只是我想應該沒有球員看到界外球打來....
會趴在地上摸著壘包等球過來打在身上......