台北市政府建管處表示，當時承辦員在辦理該案時，環評有過，且都審通過的就是十七樓，所以就發給十七樓的建照。

建管處並表示，因都審會審查時，各單位都會出席，因此該處才會認為都審既然通過，就發給建照，不過這算是行政程序不完備，必須補環評差異分析，但因體院現已決定還是興建十二樓就好，所以目前體院已到建管處辦理變更。

台北市發展局表示，過去因都審速度過慢，對於大型開發案還要等環評通過才審，經常為人詬病，因此為了加速大型公共工程審查速度，環評和都審改成可同步進行審查，所以就沒有特別去看環評結果，現在發現兩者通過的樓層數不一樣，的確是一項疏漏，但都審會基本上都是尊重提案單位提出的案子來進行審查的。

發展局坦承，當時也認為是教育局的案子，是府內工程，所以都會加速處理，才會出現這樣的疏漏。

發展局表示，現在不論公家或民間的大型開發案，環評和都審都可同步進行，有時還會出現都審通過了環評卻沒過的狀況。

體院大樓土地，現在北市都委會審議從「體育場用地」變更為「學校用地」中。