請問系統備份是放在硬碟裡或是燒在光碟上？
如果是硬碟裡，就有資料損毀的可能。

建議先用開機光碟開機後再掃瞄整顆硬碟，
不要直接用不穩定的系統執行掃瞄。

如果可以的話，把系統備份燒起來，
整顆硬碟重新格式化、分割，然後再執行系統還原，
最後再掃瞄整顆硬碟確定有無問題，如果沒問題就ok了。