若格式相同下，字幕可以被VirtualDubMOD所接受(大多數的情況下失敗機率超高，沒有字幕的話失敗率較低)，VirtualDubMOD是可以直接把兩個MKV合併
若是用MKV Merge(MKVToolNix裡頭的工具之一)的話，要有章節(章節的編輯法請另外問人)來區分，不然怎麼播放都只能播放第一個MKV(用Media Info是會看到兩個MKV，但只有第一個能放)