1.若只是開機磁區被覆蓋(例如 Vista與之後 XP是分別安裝在不同分割區或不同硬碟)，那或許還有救：可以試著使用 Window Vista安裝光碟來開機，然後選擇 "修復"。
但設若非如此，則可能連系統檔都被覆蓋掉了，目前縱有神仙軟體，應也難以回復啦。

2.VistaBootPRO只對已存在的開機檔作備份、回復、編刪等較為有用，若開機檔已毀損且又未備份，是令其無中生有，難啊。

3.建議嗣後若有做成多系統時，應「先舊後新」。例如先安裝 XP、後裝 Vista(而且應分別安裝在不同的分割區或不同硬碟)，如此後裝的系統可以識別較舊的，並在開機檔中做成雙啟動選單，這樣就不會有問題。