問題大致解決了，謝謝u8526425.小豹貓.lompt大大的幫忙
方式跟大家所說的方式相同，將兩台DNS都再加上一塊網卡，再利用區域網路來做AD覆寫，對外網路就只做DNS的服務就正常了。
(ISP的解決方式太慢了，所以先這樣弄)

由於之前公司的DNS都是這樣架的，沒聽各位說還不知道原來我的架法太危險了，呵呵.....