我前幾天也被這個問題差點害死,我的是華碩的主機板,三,四年前的舊版子,IDE盛行的年代.
最近硬碟壞軌,買了一顆SATA,單一個SATA硬碟灌系統程式都很正常,灌完系統後如果再接上一個IDE硬碟後,IDE硬碟會被設為優先.

我的BIOS在啟動順序會直接顯示出軟碟,光碟機,硬碟型號,所以一看就知道IDE硬碟被設為開機硬碟,剛開始也摸不著頭緒,後來才發現在開機優先順序下方有另一個選項,可以選擇優先讀取的硬碟,設定SATA硬碟的型號為第一優先後,在開機優先順序的硬碟型號也就由IDE變為SATA,變成SATA硬碟開機.