很簡單，您自己測看看那個效能好就知道要裝哪了
我也做過類似的選擇，因為控制晶片不同也會影響性能，
之前買過一張卡來接，就拿軟體測裝在卡上跟裝在主機板上的效能，
測出來是裝在主機板的搜尋時間快、傳輸高，系統碟就裝在主機板上，
資料碟倒是不需要很高的效能，就裝在卡上