對方所要求的處理方式很怪...

他白天沒空，那請他將證件交給你，由你去辦過戶，這樣不就得了，為何還要給車行辦?
車行辦需要代辦費，況且證件交給車行，車行也是交給監理黃牛代辦，如此下來，證件被移作他用的風險不是又提高了嗎?

付款方式:
你先附一成訂金，並當場訂下一式兩份契約書，內容詳述購車金額，以付訂金金額，餘款未付金額，契約書雙方各持有一份。
他將車子讓你騎去監理站辦過戶，事後兩人在當面結清尾款，並且在契約書上註明尾款『已付清』!
這樣在法律上就可以保障雙方的權益!