行政院海巡署下分岸局與洋局
小弟就岸總局編制解釋給各位
行政院--->海巡署--->海岸巡防總局--->北中南東4個地區局--->查緝隊,總大隊--->總大隊底下是安檢所
安檢所是負責漁船安檢作業的(所以大部分都設在港口,主要也是義務役的阿兵哥去值檢)

總大隊負責管轄安檢所~與一些業務作業(主要也都是軍人為主,軍官,士官,阿兵哥,大隊長通常是中校階~總隊長通常是上校階)

查緝隊是海巡署的主力了,海巡署的績效百分之90來自於查緝隊,但查緝隊的人員編制卻少的可憐,由簡任(或上校)隊長帶領副隊長,分隊長,專員(專員以上皆為中校階)及查緝員(少校或薦任6職等),所以查緝隊的組成有軍官,公務員(也就是特考人員)這些人的任務就跟刑警很像!

地區局負責管轄總大隊與查緝隊,局長最大(通常是簡任12職等或少將階)成員也包括科員(少校階或是薦任6職等),專員(中校階),科長(中校階),與副局長(11職等或是少將階)

再來是總局~總局負責管轄4個地區局,最大的是總局長(目前市中將階),新聞報導的特勤隊就是隸屬於總局的

再來就是海巡署~負責管轄2個總局,當然署長王進旺是特任官,理論上是隨內閣改組決定去留的

由地區局一直到署的這些所謂高司單位都是軍人與公務員混在一起的
,而公務員就是海巡特考進來的~只是有的編到查緝隊~有的編到當幕僚~只有洋總局的編制算是以警察為主!

所以說海巡署跟國防部沒關係嗎?也未必~畢竟裡頭的軍人上面的任官令都還是國防部長發的!!
以上!!!希望對大家有幫助喔!
不清楚的話可以到海巡署的官網去逛逛~感謝!