格式化=>檢查硬碟是否有壞軌後再格式化(所以格式化時間較慢)
快速格式化=>未檢查是否有壞軌就直接格式化(所以"快速")

官方資料:
http://support.microsoft.com/kb/302686/zh-cn

在 Windows XP 的「乾淨」安裝過程中，會提示您從以下格式化選項中進行選擇：
• 使用 NTFS 文件系統格式化分區（快速）
• 使用 FAT 文件系統格式化分區（快速）
• 使用 NTFS 文件系統格式化分區
• 使用 FAT 文件系統格式化分區
• 保持現有文件系統（無變化）

這篇文章介紹了快速格式化與常規格式化之間的區別。

更多信息
當您選擇在一個捲上運行常規格式化時，將從正在格式化的捲上移除文件，同時系統將掃瞄硬盤以檢查是否有壞扇區。掃瞄壞扇區的工作佔據了格式化卷的大部分時間。

如果您選擇的是快速格式化，那麼將只從分區中移除文件，而不掃瞄磁盤以檢查是否有壞扇區。只有在硬盤以前曾被格式化過並且在能確保您的硬盤沒有損壞的情況下，才可以使用此選項。

如果將 Windows XP 安裝在一個使用快速格式化選項格式化的分區上，您還可以在 Windows XP 安裝完成後通過使用 chkdsk /r 命令來檢查您的硬盤。

另外,
http://support.microsoft.com/kb/313348/zh-tw
如何在 Windows XP 中磁碟分割和格式化硬碟