我想樓主的問題，有可能只是單純的電腦效能及反應變差，因為磁碟代號已經分配。
請試一下在檔案總管按F5重新整理一下。
再不行就直接在「開始」>「執行」直接輸入磁碟代號。

都無效的話，那可能真的是usb port有問題了。換張USB2.0的卡，傳輸效能也會好很多。