就我所知，現在論文的格式大都是把參考文獻集中放在後面。我看過的論文除了一些非常舊的論文(1960年代或以前)會以註釋(footnote)在當頁標明參考文獻外，都是把參考文獻集中放在後面。

以註釋在當頁標明參考文獻有兩個問題：
1. 註釋被認為會打斷讀者的思路，應該要避免。
2. 重複引用同一文獻時會造成困擾。再列一次參考文獻，顯的多餘；不再列一次，讀者還要往前找參考文獻的資料。