剛剛找到原因了...

使用說明有這一段
3.如果電影的 FPS 非 29.97,你需要在 VirtualDub 的 " Video ->
Frame Rate -> Convert to fps: " 選項中填入 29.97.

我改的是Source rate adiustment的Change to XXX frames per second
而不是Convert to fps:

難怪影片跟字幕不同步了...

看來PSP能播放23.976 fps的影片，但可能造成影音不同步...
轉成29.97就沒問題了~~
謝謝大家~~