C絕對可以....
小弟沒學過C....所以正確的語法不敢亂寫....
不過過程就像ElvisTu說的那樣....(大部分的程式)

宣告陣列a型態大小(N)等
宣告陣列b型態大小(M)等
宣告陣列C型態大小(N+M)等
開檔案(或record)a並帶入給 陣列a
開檔案(或record)b並帶入 給陣列b
陣列a + 陣列b之後丟給陣列C
排序陣列C
開新檔(指定要存放的地方)
寫入檔案(存入到剛剛那個新開的檔案)

真的就只是這樣....