跟放的位置的中斷怎麼拉線有關
如果硬體上該槽線跟其他onboard裝置或是其他槽拉在一起
而若該卡無法跟其他裝置分享中斷,那在同時運作時就會發生問題,如此而以

MSI的手冊上不知道有沒有寫IRQ Routing Table(華碩的有)
有的話翻翻對照一下你之前的插法應該就能判斷原因了