前幾天備份亞藝 國家X藏，有遇到類似的問題。

我的狀況是：
D9轉D5燒出後，無法用DVD遙控器在影片檔播放時選擇字幕。螢幕會出現禁止的標誌。
所以需連同MENU也要保留，如果只備份主影片及字幕，是無法用遙控開關字幕或選擇字幕，螢幕會出現禁止的標誌。
簡單的說，字幕一定要用MENU去驅動才會出現。無法用DVD遙控器驅動。
另外我用的是DVD Shrink 3.2，沒用別種軟體試過。 有備份過3~4百部影片的經驗了，第一次遇到，所以不是設定上的問題，確定這片是比較特殊的。