foobar會同時搜索 foobar資料夾底下及component底下喔
所以有重複的記得要刪到剩下一個....
我通常會在像這種繁雜設定的軟體穩定之後…不太會再去調整的時候...
將他整個複製一份壓縮起來備分....
以前是winamp現在是foobar..

像你的情形好像是foobar2000.cfg有錯誤…然後foobar就重新作了個default的給你
調整好之後可以只備份這個檔案起來，以後有錯可以再塞回去...
但是對應的程式檔案、版本等..要一樣才行