把檔案總管設定成顯示隱藏檔案, 就可以看到boot.ini, 像我的boot.ini內容是

[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\WINNT
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professional" /fastdetect
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professional" /fastdetect

其中[operating systems]以下那兩行就是多重開機選單的選項, 可以直接把多餘的那行拿掉, 並把default的值改成你要的開機磁區.

舉例來說, 我的

C槽 ----> multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professional" /fastdetect

D槽 ----> multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professional" /fastdetect

都有Windows, 如果我只要留下C槽則只要把D槽那行delete掉, 並修改default的值變成

[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professional" /fastdetect

即可, 至於timeout值則因為只有一個開機設定, 因此不會有作用所以不用修改