提供你另一個解決方案(影像與音效分離),是英文的但是寫的蠻詳細,可以參考看看,我目前都是用這個解決方式
http://www.dvd-guides.com/content/view/70/59/

不然就直接用TMPGEnc Plus 2.54的版本(舊的),不用分離AC3可以直接轉檔
聽說TMPGEnc Plus 2.54以後的新版,只要灌了AC3ACM也可以直接處理AC3
可是我從來沒成功過,找不出原因,殘念.........