小弟是請問你是不是裝在第二個ide，而不是問裝在那個硬碟。
一般主機板提供ide1和ide2二個插槽。小弟有次整理電腦硬碟及排線後，再重新裝回去，在所有零件都沒變，os也完全沒動的情況下，開機時在你所說的那個登入畫面(就是歡印使用windows xp，而不是跑馬燈喔)，硬是多了很長的時間。後來才發現我把系統碟裝在第二個ide，資料碟裝在ide1(都是設定master)。把它們對調後，那個登入畫面就變得正常的快了。不過不知道是什麼原理？
所以想確認一下你是不是這種狀況。
因為我自已的經驗，常駐程式多大部份會造成在已進入windows的桌面時變慢，應該不會停在登入畫面這麼久。