會有差別是在抓音軌到硬碟上(.wav)的過程中，
如果這產生的WAVE你聽起來和來源CD一樣，那將它經過APE\FLAC化和解壓縮還原成WAVE是完全一樣的，
不會說轉APE就讓音質劣化，不過也是有人說APE播放起來還是不如WAVE，當然如果你要將APE燒CD，那燒錄過程又是一項變數，

就聆聽感覺來說，CD =>WAVE =>APE\FLAC =>WAVE =>CD，這樣燒出來的CD是有可能和來源CD有差異的，至少信誓旦旦說聽得出差異的大有人在，
不過至少WAVE<=>APE\FLAC這個步驟是不會有任何變數的。