強姦在台灣是以「妨害性自主」罪加以起訴處罰的。
也就是說，台灣的法律學者，認為強姦侵害的不是貞操權，不然的話，一個妓女根本已經談不上有何貞操了，所以她被強姦，沒有法益受侵害，豈不是可以不罰？
由於強姦的行為多半以強暴脅迫、妨害人身自由或意思決定自由的手段進行，所以強姦可以算是包攝在妨害自由裏面，雖然強姦通常伴隨傷害的結果，但是實際上不能算是傷害的一種。所侵害的是被害人的性自主權，也就是一般人應該可以以自主的意思選擇與想要的對象發生性關係的權利，而強姦行為人剝奪了被害人這項權利，所以必須加以處罰。