會否是您的 SATA 是接在外接卡或板上內建含 BIOS 的裝置呢？
如果您該 SATA 通道裝置驅動中不包含 atapi.sys，或許就不受影響也說不一定，例如您是那種 SATA 需要另裝 driver 而非類似 ICH5/6 等包含特殊支援可不需使用專用驅動程式的狀況？

個人猜測...因為由於 Windows 2000/XP 不需透過 BIOS 讀取 HDD，因此其是否支援就端賴 OS 內建的這個 atapi.sys 是否支援而定，如並不是使用這個驅動程式的話自然不受 OS 本身影響，會變成類似 SCSI 通道裝置一般。