其實這篇文章主要是討論分開轉 Video 和 Audio, 所以以下才是最好的辦法:

方法一
仍舊使用 VirtualDub, 但在另存新檔時, Video 選 Direct Stream Copy, Audio 選 no audio, 這樣可以減少 Audio Stream 對 TMPGEnc 的困擾.

方法二
我覺得最簡單的方法, 安裝 AviSynth, 寫個簡單的 .avs, 用 AviSource 來載入 .avi, 第二個參數放 False, 表示不載入 Audio stream. 之後用 TMPGenc 來讀這的 .avs 就好了.

至於 Audio 嘛, 我偏愛用 Virtualdub 直接分離出來, 再用 BeSweet 轉就好了.