因為你說的是如果...所以暫時先回答這樣

先確定會造成影音不同步的情況:
1.來源檔本身就影音不同步
2.電腦配備不夠高
3.軟體的BUG
4.解碼器的版本問題
5.轉檔同時掛字幕檔

我的經驗是甚麼不行就換甚換,或更換方法或其他軟體替代

都是需要硬體,軟體,來源檔這三者之間的配合
再加上轉檔經驗的積累,就能找出方法解決