很難避免吧...
尤其是當你多各檔案同時下載而且一各檔案有一各以上的下載正在進行
這時候都是硬碟寫入最頻繁的時候

這問題應該去專門討論emule的相關網站看別人的討論比較快
不過就我看到的結論

就是買硬碟快取大的硬碟可以"稍稍"減緩硬碟頻繁的寫入動作
或者是提高磁碟寫入/讀出的CACHE SIZES

不然就買一顆便宜的5400RPM來用，又便宜壞了也不會太痛...